Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
KLF1Q13351 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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