Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NME3Q13232 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
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