Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
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IFT88Q13099 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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