Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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