Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
GTF3C1Q12789 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GTF3C1Q12789 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms