Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NUP160Q12769 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms