Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNB1Q02641 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms