Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRMP28827 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.6 ms