Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPREP23469 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPREP23469 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPREP23469 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPREP23469 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPREP23469 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PTPREP23469 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PTPREP23469 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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