Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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