Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SHOC2Q9UQ13 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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