Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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USP18Q9UMW8 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
USP18Q9UMW8 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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