Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
EHD3Q9NZN3 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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