Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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FOXQ1Q9C009 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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FOXQ1Q9C009 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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FOXQ1Q9C009 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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FOXQ1Q9C009 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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