Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZBED3Q96IU2 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
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ZBED3Q96IU2 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZBED3Q96IU2 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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