Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CDO1Q16878 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CDO1Q16878 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CDO1Q16878 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDO1Q16878 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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