Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
DUSP6Q16828 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DUSP6Q16828 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms