Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NRF1Q16656 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms