Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZNF239Q16600 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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