Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCAQ16586 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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SGCAQ16586 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCAQ16586 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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