Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNGA3Q16281 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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