Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SF1Q15637 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SF1Q15637 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SF1Q15637 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SF1Q15637 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SF1Q15637 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SF1Q15637 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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