Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SS18Q15532 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SS18Q15532 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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SS18Q15532 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SS18Q15532 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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