Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
BRD3Q15059 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms