Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SSPNQ14714 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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