Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NEDD9Q14511 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NEDD9Q14511 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms