Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SPIDRQ14159 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SPIDRQ14159 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms