Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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