Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms