Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
NAE1Q13564 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NAE1Q13564 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms