Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NEUROD1Q13562 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NEUROD1Q13562 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms