Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
TMED1Q13445 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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