Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
XRCC4Q13426 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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