Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PLD1Q13393 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PLD1Q13393 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PLD1Q13393 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PLD1Q13393 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms