Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
AP3B2Q13367 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms