Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CLN3Q13286 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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