Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL28Q13084 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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