Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms