Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
PRDM2Q13029 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms