Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CSTF3Q12996 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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