Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NFX1Q12986 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NFX1Q12986 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NFX1Q12986 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NFX1Q12986 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NFX1Q12986 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NFX1Q12986 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NFX1Q12986 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NFX1Q12986 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
NFX1Q12986 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
NFX1Q12986 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NFX1Q12986 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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