Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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NPRL3Q12980 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
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NPRL3Q12980 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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NPRL3Q12980 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NPRL3Q12980 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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NPRL3Q12980 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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NPRL3Q12980 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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NPRL3Q12980 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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NPRL3Q12980 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NPRL3Q12980 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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