Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF2Q12947 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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