Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.1 ms