Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX13Q9Y5W8 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX13Q9Y5W8 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms