Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAPPC9Q96Q05 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms