Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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FAM3DQ96BQ1 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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FAM3DQ96BQ1 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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FAM3DQ96BQ1 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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FAM3DQ96BQ1 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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FAM3DQ96BQ1 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FAM3DQ96BQ1 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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FAM3DQ96BQ1 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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