Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ZBED9Q6R2W3 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZBED9Q6R2W3 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms