Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CCDC142Q17RM4 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms