Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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TNXAQ16473 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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TNXAQ16473 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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TNXAQ16473 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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TNXAQ16473 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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TNXAQ16473 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
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TNXAQ16473 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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TNXAQ16473 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNXAQ16473 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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